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I ricercatori dell’Università di Uppsala hanno sviluppato un nuovo metodo per rilevare le mutazioni nei tumori cerebrali nei bambini. Sono stati anche in grado di dimostrare che le mutazioni che sono state in grado di escludere con l’aiuto del metodo influenzano il modo in cui le cellule tumorali rispondono ai farmaci antitumorali.
I risultati aprono una migliore prognosi e un trattamento individualizzato per i bambini con tumori cerebrali, lo studio è stato pubblicato sulla rivista scientifica PNAS.
Il medulloblastoma è la forma più comune di tumore cerebrale maligno nei bambini. Il cancro di solito si verifica nel cervelletto e, sebbene i trattamenti moderni abbiano migliorato la prognosi in modo che il tasso di sopravvivenza a cinque anni sia superiore al 70%, non tutti i pazienti possono essere curati. Il trattamento aggressivo provoca anche gravi effetti collaterali come problemi di equilibrio e ridotta capacità di apprendimento in coloro che sono sopravvissuti al cancro.
Molti studi hanno esplorato quel raro 2 per cento del DNA umano che dà origine alle proteine, ma si sa poco del resto della massa genetica. Nel cancro, ad esempio, il 98% delle mutazioni cancerose si verifica nelle parti del materiale genetico meno studiate. Può includere migliaia di mutazioni, e quindi è difficile distinguere quali mutazioni guidano il cancro da quelle che non sono correlate.
Per ottenere un quadro completo delle importanti mutazioni nell’ameloblastoma, i ricercatori hanno utilizzato un metodo recentemente sviluppato con un consorzio internazionale. Il metodo prevede l’osservazione specifica delle posizioni conservate nel genoma e si basa sul presupposto che le sequenze di DNA che sono rimaste invariate nei mammiferi attraverso milioni di anni di evoluzione hanno probabilmente funzioni importanti.
Nel nuovo studio, tutte le mutazioni nei tumori di pazienti con medulloblastoma sono state confrontate con le informazioni su quanto bene ogni singolo locus nel genoma è stato preservato attraverso l’evoluzione. Si può presumere che le mutazioni localizzate in regioni che non sono cambiate molto siano di fondamentale importanzaafferma Ananya Roy, ricercatrice e co-prima autrice del nuovo studio.
Sul totale di 200.000 mutazioni nei 145 pazienti nello studio, un totale di 114 mutazioni sono state trovate in siti conservati nel genoma. Molte mutazioni sono state trovate in geni di cui non era stata precedentemente dimostrata la mutazione nel cancro, sebbene studi precedenti abbiano trovato diversi livelli della proteina in alcuni geni nell’ameloblastoma. Le mutazioni appena identificate erano nel DNA che contiene istruzioni che dicono dove, quando e quante proteine produrre. I risultati possono quindi spiegare precedenti osservazioni di quantità proteiche alterate nel medulloblastoma.
Ci siamo concentrati sulle mutazioni nei loci meglio conservati che potrebbero avere la massima importanza nella regolazione genica. Questo ci ha permesso di selezionare le mutazioni più importanti in un modo che altrimenti non sarebbe stato possibile e quindi testare la loro funzionedice Karen Forsberg-Nelson, uno dei ricercatori che ha condotto lo studio.
I ricercatori hanno trovato diverse mutazioni tra i pazienti in diversi gruppi di età e diversi sottogruppi di ameloblastoma e che le mutazioni hanno influenzato l’espressione genica nelle cellule di ameloblastoma in coltura.
– mostra che il nostro metodo funziona e può fornire un quadro migliore di come queste mutazioni regolano i livelli proteici nelle cellule tumoralidice Christine Lindblad Toh, anche la ricercatrice principale dietro lo studio.
Nello studio, i ricercatori sono stati in grado di dimostrare che le mutazioni esaminate nel nuovo metodo hanno influenzato la resistenza delle cellule tumorali in coltura ai farmaci. Pertanto, il nuovo metodo di analisi delle mutazioni può fornire indicazioni per farmaci adattati individualmente, la cosiddetta medicina di precisione.
Ciò significa che il modello di mutazione specifico di un paziente viene utilizzato per selezionare un farmaco che influenza i transgeni in quel particolare paziente, qualcosa che viene sempre più utilizzato nella cura del cancro.
Tuttavia, si basa sul fatto che esiste già un farmaco, un trattamento che può essere utilizzato oggi per un’altra malattia e che ora può essere utilizzato per individui con cancro che hanno la “mutazione corretta”. Le nuove scoperte potrebbero aumentare il numero di mutazioni trattabili, che a lungo termine potrebbero portare a terapie più personalizzate che possono essere offerte ai pazienti.
Affinché le analisi delle mutazioni del cancro possano essere utilizzate nei cosiddetti trattamenti di medicina di precisione, sono necessarie molte informazioni genetiche su ciascun paziente. Poiché a tutti i bambini con tumori cerebrali in Svezia viene ora offerta l’analisi utilizzando il sequenziamento dell’intero genoma, il che significa che l’intero cluster genetico del tumore è stato identificato, ci sono buone opportunità in futuro per sviluppare le analisi in modo che possano beneficiare i pazienti.afferma Karen Forsberg-Nelson.
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